从根本上说，组织创新要有利与培育、保持和提高企业的核心能力，在市场竞争中赢得持续的竞争优势。因而，企业组织创新模式的选择最终还是要看是否有利于提高企业的核心能力。可以说，核心能力是衡量企业组织创新的成效及其模式选择的最终标准。具体地说，核心能力是企业不同的技术系统、管理系统、社会心理系统、目标与价值系统等的有机结合，而体现在这种组合中的核心内涵是企业所专有的知识体系。正是企业的专有知识使核心能力表现得独一无二、与众不同和难以模仿。核心能力建诸于企业战略和结构之上，以具备特殊技能的人为载体，涉及到众多层次的人员和组织的全部职能，因而，核心能力必须有沟通、参与和跨越组织边界的共同视野和认可。

对于中国企业组织创新模式的选择来说，核心能力的影响主要是通过企业核心能力的定位和核心能力未来发展战略的确定表现出来。因为，核心能力定位直接决定了企业在战略、结构和文化方面的定位，即组织定位。没有恰当的组织定位，创新模式的选择将难以符合企业的实际。组织创新模式的选择必须紧紧围绕这两个问题展开:一方面保证企业核心技术的创新持续不断;另一方面，保证作为核心能力载体的人才能够得到全面的培养、发展以及合理使用和有效聚集。在此基础上，组织创新的模式选择还要考虑技术环境与制度环境的变化，分析组织创新动力的来源和可能获得的创新信息的源泉。所以，环境分析、创新源分析和核心能力分析一起构成了企业组织创新模式选择的重要前提，其中核心能力分析是组织创新模式选择的分析框架的基础。