赫哲族面对外敌入侵，进行了顽强的抗争。1651年10月，沙俄哥萨克头目哈巴罗夫率军入侵乌扎拉村。赫哲、奇勒尔、满等居民约千人，于10月19日向哈巴罗夫入侵者的住地发起猛攻。赫哲人手持长矛和弓箭，与沙俄入侵者进行白刃战，但终因入侵者火力过强，伤亡117人，被迫撤退。1652年4月4日黎明，宁古塔章京海色率二千余骑兵，在赫哲等居民的配合下，向沙俄侵略者的冬营地“阿枪斯克”发起进攻。清军打死哈巴罗夫所率侵略者10人，打伤76人，其中包括哈巴罗夫本人。1649-1655年，在哈巴罗夫入侵黑龙江流域的6年中，共有233名入侵者被清朝军民击毙，占532名入侵者的半数以上，给侵略者以沉重的打击。1657年，沙俄侵略者入侵松花江流域三姓附近的尚坚乌黑（白石之意），抢劫赫哲等族居民的粮食、财物和貂皮。清军在赫哲等族居民的配合下，予侵略者以沉重打击。1658年7月11日，斯捷潘诺夫带领500名哥萨克入侵松花江口的赫哲等族居民的住地，宁古塔章京沙尔瑚达统率45艘战船、1400名清军与入侵者激战，侵略军头目斯捷潘诺夫毙命，只有47人逃走。1660年夏，沙俄军队入侵黑龙江下游和松花江交汇处，大肆抢劫赫哲族居民。清军在赫哲人的配合下，在伯力以北古法坛村附近伏击敌军，击毙入侵者60多人。沙俄入侵者最终被赶出黑龙江流域。
